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RT-qPCR 既需要使用高质量 RNA 作为起始材料,也需要将 RNA 转化为 DNA 拷贝,以实现准确的实时荧光定量 PCR 检测 (qPCR)。增加 RNA 定量步骤后,您将能够更好地优化 qPCR 分析。
单击以下选项卡,了解有关优化工作流程中每个步骤的更多信息。
RT-qPCR 检测的灵敏度和准确性取决于起始 cDNA 的质量和数量,而后者又取决于分离 RNA 的质量和完整性。为避免假阳性和背景,去除基因组 DNA 是一个重要步骤。 使用赛默飞世尔科技的 Invitrogen Ambion RNA 纯化产品时,有助于简化实时荧光定量 PCR 的 RNA 提取。 您也可以使用 Cells-to-CT 直接从细胞中获取 RT-qPCR 结果。 比较适用于新鲜和冷冻细胞的 RNA 分离试剂盒: | ![]() |
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快速&可靠的方法 | 高通量纯化 | 来自大多数样本的 microRNA | 来自珍贵微量样本的 RNA | |
PureLink RNA 小量提取试剂盒 | MagMAX-96 总 RNA 分离试剂盒 | mirVana miRNA 分离试剂盒 | RNAqueous-Micro 试剂盒 | |
分离的 RNA 类型 | 仅大 RNA 分子(mRNA 和 rRNA) | 仅大 RNA 分子(mRNA 和 rRNA) | 小分子 RNA & 大分子 RNA(microRNA、tRNA、mRNA、rRNA) | 小分子 RNA & 大分子 RNA(microRNA、tRNA、mRNA、rRNA) |
分离方法 | 快速、便利的硅胶柱 | 磁珠法,可扩展,形式灵活 | 纯度较高且便利;同时包括有机提取和硅胶柱 | 快速、便利的低洗脱量硅胶柱 |
制备时间 | 20 分钟 | <45 分钟 | 30 分钟 | 15 分钟 |
起始材料用量 | 10 mg 至 100 mg 组织 多达 5 x 107 个细胞 | 多达 10 mg 组织 多达 100,000 个细胞 | 多达 100 mg 组织 多达 1 x 107 个细胞 | 多达 10 mg 组织 多达 100,000 个细胞 |
试剂盒规格(反应) | 50 | 96 | 40 | 50 |
为可靠地生成 cDNA 第一链,SuperScript IV VILO 预混液可为您提供在增强的缓冲系统中配制的成熟 SuperScript IV 逆转录酶。可减少低丰度或高丰度基因产物的扩增偏倚,并获取在多种起始材料中表现出卓越线性的数据。 SuperScript IV VILO 预混液以便利的单管规格提供,可带来简化且节省时间的工作流程,并有助于降低污染风险。 | ![]() |
RT-qPCR 检测的灵敏度和准确性取决于起始 cDNA 的质量和数量,而后者又取决于分离 RNA 的质量和完整性。为避免假阳性和背景,去除基因组 DNA 是一个重要步骤。 使用赛默飞世尔科技的 Invitrogen Ambion RNA 纯化产品时,有助于简化实时荧光定量 PCR 的 RNA 提取。 您也可以使用 Cells-to-CT 直接从细胞中获取 RT-qPCR 结果。 比较适用于新鲜和冷冻细胞的 RNA 分离试剂盒: | ![]() |
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分离方法 | 快速、便利的硅胶柱 | 磁珠法,可扩展,形式灵活 | 纯度较高且便利;同时包括有机提取和硅胶柱 | 快速、便利的低洗脱量硅胶柱 |
制备时间 | 20 分钟 | <45 分钟 | 30 分钟 | 15 分钟 |
起始材料用量 | 10 mg 至 100 mg 组织 多达 5 x 107 个细胞 | 多达 10 mg 组织 多达 100,000 个细胞 | 多达 100 mg 组织 多达 1 x 107 个细胞 | 多达 10 mg 组织 多达 100,000 个细胞 |
试剂盒规格(反应) | 50 | 96 | 40 | 50 |
为可靠地生成 cDNA 第一链,SuperScript IV VILO 预混液可为您提供在增强的缓冲系统中配制的成熟 SuperScript IV 逆转录酶。可减少低丰度或高丰度基因产物的扩增偏倚,并获取在多种起始材料中表现出卓越线性的数据。 SuperScript IV VILO 预混液以便利的单管规格提供,可带来简化且节省时间的工作流程,并有助于降低污染风险。 | ![]() |
Deben, C et al.(2013) 存档材料表达分析回顾:分离和定量从 FFPE 样本中提取的 RNA 。Diagn Mol Pathol 22(1):59-64.
“与分光光度分析相比,荧光分析更适用于定量从 FFPE 组织中提取的 RNA 样本。”(Qubit® RNA 定量)
Simbolo, M et al.(2013) 组织病理学样本下一代测序的 DNA 定性检测工作流程。PLoS One 8(6):e62692.
“使用 NanoDrop 测定的 DNA 浓度高于使用 Qubit 时的相应值,其与 qPCR 法 dsDNA 定量测定的一致性仅限于 FF 样本和细胞系中的高分子量 DNA,其中总 DNA 和 dsDNA 数量几乎重合。对于 FFPE 样本中部分降解的 DNA,经证实仅在使用 Qubit 时具有高度可重现性,且与 qPCR 测量结果一致。”