GeneChip ™ 小鼠外显子 1.0 ST 阵列为研究人员带来新的深入见解和强大的关键信息。
每个外显子有大约四个探针而每个基因有大约 40 个探针,GeneChip™ 小鼠外显子 1.0 ST 阵列能够实现对基因表达和选择性剪接进行两个互补水平的分析。
每个外显子的多个探针启用“外显子水平”分析,让您能够区分基因的不同异构体。对全基因组层级的此外显子水平分析打开了一扇大门,可以检测出在疾病机制和病因中可能具有核心作用的外显子使用方面发生的具体改变。
第二水平是“基因水平”表达分析,其中不同外显子上的多个探针被归纳为来自相同基因的所有转录本的表达值。
外显子阵列可以全方位覆盖整个基因组,包括经验支持的和预测的转录序列,能够发现以前未确认的新事件。
阵列特征•较高分辨率表达分析,可处理整个基因组已知和预测的转录区域内超过 1 百万个外显子簇。
•定制 GeneChip™ 全转录本 (WT) 测定和试剂,可利用随机引发方法在整个转录本长度上产生有意义靶标。
•灵活的数据分析解决方案和全面的注释,使您有机会在各种用户定义的工作流程中探索和剖析数据。
探针集:120 万
外显子簇:∼1 百万
推定全长 mRNA 支持:266,220 个探针集
Ensembl 转录本支持:266,791 个探针集
EST 支持:554,003 个探针集
人或大鼠 mRNA 支持:214,763 个探针集
基因预测支持:835,897 个探针集
探针选择区域:转录本全长
探针集/探针选择区域:4
1本底扣除策略:多达 1,000 个具有相同 GC 含量的本底探针的中等强度
每个阵列的总特征点:>4,500,000
检测的链:有义
2 1因为特征选择区域长度和序列限制,约 10% 的外显子探针集拥有少于四个探针。
2 阵列上平铺的探针采用反义方向设计,需要将有义链标记的靶标杂交到阵列上。根据惯例,该阵列称为 ST 阵列,表示使用有义靶标的必要性(将标记的样品杂交到阵列上)。
入门套装 为确保通过 GeneChip™ 外显子阵列系统获得较佳结果,强烈
建议新用户从入门套装开始。
每个入门套装包含:
•GeneChip™ 小鼠外显子 1.0 ST 阵列(30 个阵列)
•GeneChip™ WT 有义靶标标记和对照试剂(30 次反应)
•现场培训包括以下用于培训的阵列和试剂:
•GeneChip™ 小鼠外显子 1.0 ST 阵列(10个阵列)
•GeneChip™ WT cDNA 合成和扩增试剂盒(10次反应)
•GeneChip™ WT 末端标记试剂盒(10次反应)
•GeneChip™ 样品纯化模块(30次反应)
•GeneChip™ 真核 Poly-A RNA 对照试剂盒(100次反应)
•GeneChip™ 杂交对照试剂盒(30次反应)
外显子表达分析的新型 XRAY 演示 •观看使用 Biotique 的 XRAY 分析 GeneChip™ 外显子阵列的典型工作流程的两分钟演示视频
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Quicktime •观看两分钟演示视频,此视频解说来自 Biotique 的 XRAY 的 GeneChip™ 外显子阵列数据
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