Oncomine™ 肺 cfDNA 检测

Oncomine™ Lung cfDNA 检测是检测 cfDNA 中肺癌肿瘤来源 DNA (ctDNA) 的完整研究解决方案的一部分。其提供了文库构建试剂，以及用于从一管全血的血浆组分中获得的无细胞 DNA (cfDNA) 中制备扩增子文库的一池多重 PCR 引物。该检测可帮助研究人员分析非小细胞肺癌 (NSCLC) 经常突变的单核苷酸变体和短插入缺失。覆盖 11 个基因和 >150 个热点（基因：ALK、BRAF、EGFR、ERBB2、KRAS、MAP2K1、MET、NRAS、PIK3CA、ROS1 和 TP53）。通过使用专有测序技术，可实现低至 0.1% 的检测限 (LOD)。

注：可在下文‘文件’中找到使用 Torrent Suite 软件 5.2 进行 cfDNA 变体分析的靶标和热点 BED 文档和用户指导文件。

•用于短 cfDNA (∼170 bp) 的优化扩增子设计
• 检测单核苷酸变异 (SNV) 和低至 0.1% LOD 的短插入缺失
• 优化的靶向测定试剂盒设计可进行高度多重下一代测序 (NGS)，降低测序成本
• 非常高的灵敏度和特异性，可使用较小假阳性进行极低水平检测
• 高效工作流程，从一管血液到得出结果仅需 2 天

为什么病理科医生和肿瘤科医生关注液体活检临床癌症研究？液体活检相比于传统实体肿瘤样本检测的优势：
• 微创获取，可多次采集肿瘤内容物样品
• 与传统组织采样相比成本更低
• 从采样至得到结果的周转时间更短
• 有助于捕获更多肿瘤的异质性
• 可改善未来标准诊疗

使用 Ion Chef™ 系统和 Ion S5™ XL 测序系统可仅在 2 天内完成从使用 MagMAX™ 无细胞 DNA 分离试剂盒进行 cfDNA 分离到样品分析的整个工作流程（下图）。

与具有低 LOD (1-5%) 的其他技术不同，Oncomine 肺 cfDNA 测定试剂盒具有低至 0.1% 的灵活检测限或在 1,000 个野生型拷贝背景中具有 1 个突变体拷贝。为了达到 0.1% LOD，需要 20 ng cfDNA 上样量。cfDNA 用量可以更低，但 LOD 将更高，这取决于上样量。

简单性、速度和可扩展性
Oncomine 肺 cfDNA 测定试剂盒只需 1 ng cfDNA 上样量即可进行靶向文库构建从而进行癌症基因研究。cfDNA 检测试剂盒使用标准 PCR 设备和 2 次简单的 PCR 反应，一次用于测序，另一次用于扩增文库以进行高度多重 PCR 靶标的选择，这将减少扩大资本投资的需求。此外，Oncomine Lung cfDNA 检测试剂盒与 FFPE 样品兼容，可用于潜在的一致性研究。靶向文库的总时间通常仅为 3.5 小时。使用标签测序条形码套件 1-24 实现可扩展性和灵活性