牛 ISAG SNP 亲缘关系Panel (2013) 包含靶向 200 个 ISAG 推荐的 SNP 的引物,可使用
AgriSeq 靶向测序法基因分型 (GBS) 工作流程进行简单的多重分析。国际动物遗传学会 (ISAG) 已经标准化了一组位点包括 100 个核心 SNP 和 100 个额外的 SNP,具有足够的次要等位基因频率和基因组间距,可以准确测定各个品种的牛的亲缘关系(
从 ISAG 网站下载 SNP 信息 (.xls))。经使用 2015 ISAG/ICAR 牛 SNP 基因分型第三比较样品盘进行验证,我们全面的牛 ISAG 亲缘关系Panel可为动物亲缘关系鉴定提供可靠的基因分型结果。
主要特点包括:
•实现200个 ISAG 推荐标记的可重现基因分型
• 简单、高通量的工作流程
• 可定制的方法,可与兼容的性状或缺陷标记配合使用
对于不同品种实现 >98% 的基因分型检出率基因分型覆盖度和可重现性对于准确确定近亲群体内的亲缘关系至关重要。使用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程评估了代表19 个不同的牛品种的96个高度多样化的牛 gDNA 样品,样本间平均检出率为 98.5%,重复样本之间基因分型一致性 >99.6% (见下图)。
简单、高通量工作流程牛 ISAG SNP 亲缘关系检测组合 (2013) 经优化适用于 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程。每张测序芯片可以混合 384 份个体样品,大大降低了每只动物的测序成本和工作量。此外,该工作流程可与多种简单的 DNA 提取试剂盒兼容,包括 DNA ExtractALL 裂解试剂及其简单的 5 分钟 2 个步骤的实验方案,可以帮助进一步减少获得结果所需的时间和工作量(见下图)。
为最大化检测的价值,支持定制,可与其它性状或缺陷标记Panel合并AgriSeq 靶向 GBS 工作流程非常灵活,可以添加兼容的标记或合并兼容的Panel,以高效地获得高价值的数据。无论您希望将亲缘关系分析与特定的重要经济性状标记结合,以改善畜群管理,还是与遗传缺陷标记相结合,以在育种计划中剔除携带者,我们专门的农业基因组学生物信息学专家团队均可帮助您设计高性能的Panel。
注:牛 ISAG SNP 亲缘关系Panel分析所需的
Bos taurus 参考基因组可通过联系技术支持获得。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.