Oncomine™ TCR Beta-LR 检测

Oncomine TCR Beta-LR 检测设计用于测序 T 细胞受体 β 链重排、测量 T 细胞多样性和克隆扩增。本检测利用了在 Ion GeneStudio S5 下一代测序系统上新开发的长读长测序技术。该检测试剂盒提供了单个多重 PCR 引物、文库试剂和样品条形码库组合。Ion AmpliSeq 文库可通过诸如从全血、新鲜冷冻组织或 FACS 分选细胞中提取的 RNA 等研究样品生成 Ion AmpliSeq 文库。

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该检测旨在高效捕获 TCR β 链 (CDR1, CDR2, CDR3) 的所有三个互补决定区，具有较高的准确度。它可实现关键应用，如预测或预后生物标志物发现、T 细胞表征和可变基因多态性的鉴定。可使用灵活的 RNA 起始量（最低 10 ng，最高 1 μg）来鉴定罕见的高丰度克隆。使用 RNA 模板可实现对生产和相关变量 (V)、多样性 (D) 和连接 (J) 重排进行测序—改进罕见克隆的鉴定。

备注：有关使用 Ion Reporter 软件 v5.6 进行数据分析的信息，请参阅下面的用户指南。

Oncomine TCR Beta-LR 检测的优势包括：
•长读 RNA 测序（最多 400 bp 扩增子长度）全面覆盖 TCR β 链
•广泛的动态范围内的克隆检测
•通过 Ion AmpliSeq 技术生成的无偏移输出
•有效的工作流程，从样品到结果所需时间为 48 h
•灵活的起始量要求，范围为 10 ng 至 1 μg
•与多种研究样品类型兼容，包括新鲜冷冻组织、全血和分选细胞
•简化和用户友好的信息学解决方案，具有多样品分析功能

为什么免疫学者和免疫肿瘤学家对 T 细胞所有组成部分测序研究感兴趣？
•表征血液和浸润肿瘤中 T 淋巴细胞的多样性并监测其特点
•确定与自体免疫疾病或免疫介导的不良反应有关的变体基因多态性
•优化治疗或工程化 T 细胞的生产和功能

与其他技术不同，Oncomine TCR Beta-LR 检测可提供：
•长读测序，能够全面覆盖 TCR β 链
•通过卓越的多重 PCR 设计实现高准确度和灵敏度
•使用极低起始量 RNA (10 ng) 作为起始材料
•每样品具有高倍增和低成本，能够实现大规模研究
•通过快速周转时间加快发现周期

整个工作流程（下图），从 RNA 分离到样品分析，可使用 Ion Chef 模板制备系统和 Ion S5 或 Ion S5 XL 测序系统在两天内完成。