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Life Technologies 的 Applied Biosystems® Arcturus® Paradise® PLUS 全转录本 RT (WT-RT) 试剂系统提供了一种高效可靠的解决方案,可纯化从存档的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织样本中提取的 RNA,然后逆转录整个转录本以用于实时荧光定量 PCR。
FFPE 样本为基因表达谱分析和基因表达定量测定带来了独特的挑战,包括 RNA 分子的化学修饰和片段化。由于 RNA 降解随时间推移增加,因此 FFPE 样本的存档也成为挑战之一。
对 Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统进行了专门开发和特别优化,以从存档 20 年以上的 FFPE 样本中获得的高度片段化 RNA 中提供高质量的 RNA 和稳健的逆转录 (RT)(图 2)。
表 1 显示了使用 Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统和类似的市售方案获得的总 RNA 得率之间的比较。三次重复分离的平均得率证明了使用 Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统获得的总 RNA 的丰度。Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统可产生大量的总 RNA,用于逆转录和后续 qPCR 分析,比使用类似的市售产品处理相同样本时获得的总RNA多三倍。
表 1.使用 Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统和类似的市售方案获得的总 RNA 得率之间的比较。
样本 ID | 样本年龄 | 260/280 | RNA 分离方案 | 平均得率 (ng) |
---|---|---|---|---|
9055 | 1 年 | WT-RT | 1.94 | 7592.8 |
供应商 A | 2.05 | 2086.3 | ||
8090 | 10 年 | WT-RT | 1.95 | 784.4 |
供应商 A | 2.45 | 247.4 |
对 Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统的灵敏度与市面上生成用于实时荧光定量 PCR 反应的 cDNA 的类似试剂产品进行比较。使用 Paradise® PLUS 产品时,所有高、中、低表达基因的 Ct 值均有所改善(图 2)。使用与转录本 3’-末端相距不同距离(500 bp 至 5 kb)的外显子跨区引物,与其他市售产品相比,显示出了更高的灵敏度和更高的转录成功率。Paradise® PLUS WT-RT 试剂系统成功扩增了所有基因,因为试剂盒中提供的试剂已经过优化,可协同工作,不仅节省了您的时间和精力,同时也在整个转录本中产生了高质量结果。
图 2.使用 Paradise® PLUS 产品时,所有高、中、低表达基因的 Ct 值均有所改善。 |
Paradise® PLUS 试剂系统已作为 Arcturus® 完备系统(一种利用少量 RNA 进行基因表达分析的集成式解决方案,适用于 Microgenomics®)的一部分进行了验证,并且配备了用来获得纯细胞群的 Arcturus 激光捕获显微切割 (LCM) 仪器。适用于微基因组学的 Arcturus 系统可实现准确、灵敏的微阵列测定,这些测定可揭示在全组织样本或细胞混合物中会被掩盖的分子特征。
仅供研究使用。不可用于诊断程序。